Den tidligere Navy-SEAL og agent i Secret Service, Scot Harvath, redder Dr. Anthony Nichols liv, da en bilbombe eksploderer i Paris. Dr.Nichols er professor i historie og er ansat af USA’s præsident. Han arbejder i al hemmelighed på et betydningsfuldt projekt, som har forbindelse til den tidligere amerikanske præsident Thomas Jeffersons studier af Koranen.

I Rom bliver en anden videnskabsmand, den anerkendte koranforsker, Dr. Marwan Khalifa, brutalt myrdet, mens han arbejdede med et sjældent fund fra en udgravning i Yemen. Lige som præsident Jefferson er Dr. Khalifa kommet på sporet af en ældgammel hemmelighed, som vil kunne fjerne grundlaget for den militante islamisme. Men stærke kræfter er parat til at gøre alt for, at sandheden skal forblive skjult.

Snart befinder Scot sig midt i en hæsblæsende og brutal kamp, og han må sande, at en yderst professionel snigmorder har indledt en nådesløs jagt på alle, som kender til hemmeligheden.